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鸟类学研究组有关鸟类适应青藏高原特殊环境的基因组学证据的研究成果在Nature Communications发表
发表日期: 2013-07-19   来源: 进化室 科技处   发稿人: 朱江  

地山雀(Parus humilis)是青藏高原的特有鸟种,属山雀科鸟类。由于其形态特征与地鸦相近,曾长期被认为是鸦科鸟类,并被命名为“褐背拟地鸦”。动物进化与系统学院重点实验室雷富民研究员领导的鸟类学研究组与诺禾致源合作,对地山雀开展全基因组de novo测序,同时对另外两种山雀(大山雀和黄颊山雀)以及黑尾地鸦进行了重测序比较分析。研究结果从基因组水平进一步确证了地山雀是“山雀”而非“鸦”的分类地位,并初步揭示了该物种适应青藏高原极端环境的遗传印迹。结果显示,地山雀与黄颊山雀、大山雀的亲缘关系很近,估算分化时间在7.7-9.9个百万年之间。通过与原鸡、火鸡和斑胸草雀的基因组数据比较,发现地山雀基因组中与能量代谢相关的基因家族发生了扩张,而与免疫和嗅觉相关的基因家族发生了收缩;通过对7190个直系同源基因的比对,发现与低氧反应和骨骼发育相关的基因经历了正向选择以及不同程度的快速进化。上述结果进一步揭示了地山雀为适应青藏高原的特殊环境,产生了基本的生存适应策略演化,以及由山雀向鸦的形态特征转变。

该成果于2013年7月1日在线发表于 Nature Communications杂志(doi:10.1038/ncomms3071)(论文链接)。

本研究得到国家杰出青年科学基金(30925008),重大国际合作基因(31010103901)以及动物研究所生命科学领域“十二五”基础前沿研究专项(KSCX2-EW-J-2)等的资助

对68个单拷贝直系同源基因的系统发育分析,揭示了地山雀与大山雀和黄颊山雀比黑尾地鸦具有更近的亲缘关系。其分化时间(红色数据)及支持率(节点上部)见图中的相应标识。
 

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