周旭明团队探究胰岛素/IGF-1通路演化与消化细胞功能起源
胰岛素/IGF-1通路对多种动物寿命和衰老速度的影响已在包括线虫、果蝇和小鼠在内的多种模式生物中得到验证。同时,多项针对长寿人群的研究已证明人类衰老表型与胰岛素/IGF-1信号通路基因的遗传变异之间存在关联。脊椎动物胰岛素调控葡萄糖代谢、食欲和身体生长且由Pdx1蛋白标记的胰腺内分泌细胞产生,而无脊椎动物,例如线虫和果蝇,则多数在中枢神经而非消化组织中产生胰岛素样肽(insulin-like peptide,ILP)。
近期,中国科学院动物研究所周旭明研究员团队通过解析和比较脊索动物文昌鱼与人、小鼠等脊椎动物的胰岛素/IGF-1信号通路关键基因,利用Ilp1、Ilp2和Ilpr基因敲除文昌鱼,探索了中肠标记蛋白Pdx和Ilp基因之间的相互作用及Ilp蛋白在文昌鱼中的功能,发现Ilp基因表达不受Pdx控制,且Ilp蛋白主要调节动物的身体生长过程。上述结果支持Pdx介导的胰岛素基因表达调控以及胰岛素内分泌细胞在肠道中的聚集可能是脊椎动物独有特征,为推演脊椎动物的胰腺以及代谢调控通路演化过程提供了较为直接的证据。
该研究首先通过转录组分析论证了文昌鱼肠道内存在区域化功能分割,且特定区域可能由ParaHox家族基因Pdx和Cdx定义。这两个基因分别标记脊椎动物的中肠(胰腺和十二指肠)和后肠(小肠和大肠)组织。单细胞转录组显示,文昌鱼肠道有分泌类似脊椎动物肽类激素Sst-like和PACAP/GCG多肽的内分泌样细胞簇及共表达Ilp1和Ilp2基因的细胞,且Pdx基因不在上述内分泌类细胞中表达。其中,文昌鱼Sst-like和PACAP/GCG高表达内分泌样细胞与斑马鱼内分泌细胞类型表现出很强的整体转录组相似性。然而,与脊椎动物不同,这些文昌鱼内分泌样细胞位于肠道的不同区域,且它们均不表达脊椎动物胰腺特异基因Pdx。
随后,Pdx突变体的肠道单细胞测序结果显示,文昌鱼Pdx蛋白可能调节一些参与脊椎动物胰腺发育的保守转录因子基因的表达,例如Nkx6,而Pdx基因阳性细胞簇并没有内分泌细胞特征。相反,Pdx基因标记的文昌鱼中肠细胞主要功能可能是推动食物颗粒在肠道内移动。
最后,通过系统比较Ilp1、Ilp2及Ilpr基因突变品系后,结果进一步证实了文昌鱼Pdx蛋白并没有直接调控Ilp1和Ilp2基因表达的能力。其中,Pdx表达仅限于成年文昌鱼中肠的特定区域,而文昌鱼Ilp1和Ilp2基因则不在这个区域表达。基因敲除实验表明,Ilp1蛋白在控制幼鱼身体生长方面发挥类似脊椎动物胰岛素样生长因子的功能,而与脊椎动物胰岛素不同,Ilp1和Ilp2基因表达水平对进食的反应较弱。此外,文昌鱼Ilp1多肽能够与文昌鱼Igfbp蛋白产生微弱相互作用,与脊椎动物Igf1和Igfbp蛋白互作的典型特征相似。
相关研究结果以题为“Single-cell profiling of the amphioxus digestive tract reveals conservation of endocrine cells in chordates”发表在Science Advances。中国科学院动物研究所博士后戴漪晨为该文第一作者。中国科学院动物研究所周旭明研究员和厦门大学生命科学学院李光教授为论文共同通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、中国博士后管理委员会博士后引进项目、中国科学院动物所秉志博士后计划、中国科学院动物所自主部署项目等支持。
原文链接:https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adq0702
Ilp1、Ilp2和Ilpr蛋白功能结果及其演化
文昌鱼消化组织单细胞转录组及其特征
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