姓 名: | 张 勇 |
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学 科: | 计算进化基因组学 |
电话/传真: | +86-10-64806339 / +86-10-64806339 |
电子邮件: | zhangyong@ioz.ac.cn |
通讯地址: | 北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所A627 100101 |
更多信息: | 计算进化基因组学研究组 |
简历介绍:
张勇于2006年获北京大学生物信息学博士学位,2007年至2011年于芝加哥大学从事研究,2011年通过国家高层次人才计划(青年)加入中国科学院动物所任研究员。他长期聚焦物种特异重复基因的功能、介导基因重复的突变机制及突变机制的转化研究,在前沿基础研究和国家战略需求两方面获得系列成果。包含Cell (In press)、Nature Ecology Evolution (2022/2024)、Nature Biotechnology(2023)等论文在内,张勇共发表论文70余篇,总引用达8100次(Google Scholar);获批国内专利一项,申请国际专利两项;主持国家杰出青年科学基金、优秀青年科学基金、中国科学院从0到1原始创新等项目。更多信息请访问http://zhanglab.ioz.ac.cn ;动物所内部请访问http://10.0.60.55/ 。
研究领域:
1)基础研究:刻画新基因起源机制,揭示新基因对表型进化的意义。
研究组开发基于从头拼接的新方法,在果蝇与人类群体中鉴定串联重复,发现与传统假定不同,串联重复多不能产生完整基因拷贝,但仍可通过基因融合等机制产生新基因结构,具有较大功能后果。该工作发表于Nature Ecology Evolution(2022)。研究组也在多种动物基因组中发现基因/转座子嵌合现象并解析其机制,即微相似序列在复制中介导模板跳转。这些工作发表于Genome Research(2016)、Nature Communications(2021)。
不仅如此,研究组开发了基因年龄推断方法,产生了高质量新基因数据集,发现其在人大脑等快速演化的器官中上调。这些工作发表于Genome Research(2019)、Developmental Cell(2021)等。研究组也解析了脊椎动物早期的进化,揭示早期产生的重复基因推动了脊椎动物祖先的发育进化;该工作发表于Nature Ecology Evolution(2024)。
2)应用研究:从基因起源演化的概念和方法出发,开发具备自主知识产权的新技术。
由于转座子编码的TnpB与基因编辑器Cas12源自同一基因家族,研究组开发新方法从原核基因组中基于进化信息预测活跃的TnpB,结合实验鉴定了目前最小的基因编辑器,方便了体内递送。这一工作发表于Nature Biotechnology(2023)。类似的,研究组从动物基因组中挖掘了40个新的转座子载体,使其数量从20上升到60;其中活性最高的新载体性能在CAR-T免疫治疗中优于常用的慢病毒。该工作发表于Cell(In press)。研究组也开发了基于转座子的非扩增三代测序微量建库技术,方便了小动物或珍惜样品的测序组装,投稿至Nature Communications(Accepted in principle)。
社会任职:
获奖及荣誉:
承担科研项目情况:
代表论著:
(*: co-first authors; #: co-corresponding authors)
其他工作(2015年以后):
写给考生的话: