飞蝗两型small RNA转录组的鉴定比较

农业虫鼠害综合治理研究国家重点实验室康乐研究组应用高通量测序的方法在飞蝗中发现了大量的small RNA。研究人员通过与其它昆虫small RNA的比对发现了50种保守的miRNA, 并且发展了一种新的方法在没有基因组序列的前提下挖掘飞蝗特有的miRNA,发现了大约185种飞蝗特有的miRNA candidates。本研究还阐述了miRNA*的保守性,以及昆虫miRNA的进化机制,大量的endo-siRNA以及piRNA也在飞蝗中鉴定出来。同时研究并发现飞蝗群散两型在small RNA的表达谱上面存在着巨大的差异,揭示了small RNA在飞蝗型变中可能起到的巨大作用。

Length distribution and composition of the small RNA libraries in gregarious and solitary locusts. Nt, nucleotides.

相关研究发表在 Genome Biology 杂志上

Wei YY, Chen S, Yang PC, Ma ZY, Kang L: Characterization and comparative profiling of the small RNA transcriptomes in two phases of locust. Genome Biol 2009, 10(1): R6 (IF: 6.59)

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