禽流感是一种由甲型流感病毒的一种亚型（也称禽流感病毒）引起的传染性疾病，被国际兽疫局定为甲类传染病。通常只感染鸟类，很少情况会感染猪。禽流感病毒高度针对特定物种，但在罕有情况下会跨越物种间障碍感染人。自从1997年在香港发现人类也会感染禽流感之后，此病引起全世界卫生组织的高度关注。其后，本病一直在亚洲区零星爆发，但在2003年12月开始，禽流感在东亚多国──主要在越南、韩国、泰国──严重爆发，并造成越南多名病人丧生。直到2005年中，该病不但未有平息的迹象，而且还不断扩散，远至东欧多个国家。

中国科学院动物研究所何宏轩研究组通过对215个人源的H5N1病毒株和5885个禽源的H5N1病毒株的HA序列进行分析，并结合地理信息学数据和鸟类迁徙动态数据，综合分析认为：（1）全球人源H5N1病毒株分为4个大分支，即Southern China cluster （华南分支，CN）, Indonesia cluster （印度尼西亚分支，ID）, Indo-China cluster （印支分支，IC） and Middle Asia-north Africa cluster （中亚-北非分支，MN）。进一步的糖基化为点分析，这四大分支属于3大病毒类型，即广东196型或原始型（the GD196 type or original type），过渡性（the Transitional type）和印度尼西亚型（the Indonesia type）。这些结果表明了，全球人源H5N1病毒株根据地域不同存在不同的进化亚型，而且在防控上也要选用同地域毒株制备疫苗；（2）在进化分支上，人源H5N1病毒株分散在禽源的H5N1病毒株中，这个结果表明了人源H5N1病毒株来源于禽源H5N1病毒株，不同地域病毒传播是通过鸟类来传播的，而人与人之间或人与鸟之间单项不能直接传播。（3）从病毒溯源上来看，本研究的结果推测华南很可能多个病毒支系的共同来源。综上所述，我们了解到，人感染H5N1 禽流感病毒多是接触了感染H5N1病毒的病禽而感染，从发生的人病例的事实来看，符合这一说法。该研究提出的对全球流感毒株的分型和分类的方法尚属首次，对于未来研究禽流感的进化具有重要的参考价值。

该研究结果发表在Journal of Infectious Diseases: Bin Wu, Chengmin Wang, Guoying Dong, Yunhai Guo, Dale Louis Nolte, Thomas Jude Deliberto, Jianguo Xu,Mingxing Duan, Hongxuan He.New evidence suggests southern China as a common source of multiple clusters of highly pathogenic H5N1 avian influenza virus. The Journal of Infectious diseases, 2010，202:452–458.（IF=5.865）.（原文链接）