双链DNA中G-quadruplex形成规律
基因组中G-四重折叠结构的形成受到旁侧双链序列的约束和互补链形成双链的竞争。这种情况下G-四重折叠结构是否能够形成或者说在什么条件下可以形成是一个重要的问题。动物所所谭铮研究组使用DMS footprint以及非变性凝胶电泳的方法观察到了来自基因组长双链中RAN转录时G-四重折叠结构的形成,并发现PEG模拟的分子拥挤环境对G-四重折叠结构的稳定存在起着关键的促进作用。这结果揭示了双链DNA中G-四重折叠结构形成的物理基础,同时也为细胞内基因组中存在G-四重折叠结构提供了支持证据。
文章链接:Zheng KW, Chen Z, Hao YH, Tan Z. 2010. Molecular crowding creates an essential environment for the formation of stable G-quadruplexes in long double-stranded DNA. Nucleic Acids Res 38(1): 327-338.(原文链接)
该项研究得到了国家科技部和国家自然科学基金的资助。