| 姓 名： | 金坚石 |
|---|---|
| 学 科： | 生物技术/基因组学/分子生物学 |
| 电话/传真： | +86-10-64807550 / |
| 电子邮件： | jinjs@ioz.ac.cn |
| 通讯地址： | 北京市朝阳区北辰西路1号院5号 中国科学院动物研究所 农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室 100101 |
| 更多信息： | 菌群生物学与智能调控研究组 |
简历介绍：
金坚石，博士，研究员，博士生导师；中国科学院动物研究所农业虫害鼠害综合治理研究国家重点实验室菌群生物学与智能调控研究组组长。
2009年和2014年分别获得南京大学学士和北京大学博士学位。2010-2011前往哈佛大学访问学习。2014-2016年在北京大学生命科学学院从事博士后研究。2016-2023年在日本理化学研究所先后担任JSPS fellow、Research Scientist、Senior Scientist。
主要从事单细胞测序、显微成像和智能化系统等的研发工作，研究肠道菌群和转录调控等复杂系统相关的生物学问题。研究成果发表于Science，Nature Communications, Nature Protocols, Science Immunology，PNAS，The Journal of Immunology等杂志。已申请多国PCT专利。曾获得日本理化学研究所“樱舞赏”，日本JSPS博士后奖学金，北京大学优秀博士论文，北大-清华生命科学联合中心优秀博士后基金等。
研究领域：
菌群在生态系统中处于非常重要的地位，不但参与环境中能量和物质的循环，同时也对宿主（如动物）的健康和疾病至关重要。这为利用菌群预测或控制农业有害动物爆发、保护生物多样性、改善人类健康和生活质量等提供了新思路。本课题组将通过研发和应用基于大数据采集与分析的精确技术，特别是基于测序和成像的单细胞技术，从环境或共生菌群发现重要的功能微生物并研究其生物学，在此基础上结合人工智能和生物技术实现对菌群的精准调控，同时为调控动物的繁殖与行为、改善环境或宿主健康等提出理论或开发具体技术。
社会任职：
获奖及荣誉：
承担科研项目情况：
国家重点研发计划课题，主持，2023-2026
日本理化学研究所奖励研究基金，主持，2020-2022
日本学术振兴会外国人特别研究员奖励基金，主持，2017-2019
日本学术振兴会启动专项基金，主持，2016-2017
代表论著：
（#通讯作者 *共同第一作者）：
12. Jianshi Jin#, Reiko Yamamoto, Katsuyuki Shiroguchi#, High-throughput identification and quantification of bacterial cells in the microbiota based on 16S rRNA sequencing with single-base accuracy using BarBIQ. Nature Protocols, 2023, https://doi.org/10.1038/s41596-023-00906-8.
11. Jianshi Jin*, Taisaku Ogawa*, Nozomi Hojo, Kirill Kryukov, Kenji Shimizu, Tomokatsu Ikawa, Tadashi Imanishi, Taku Okazaki, Katsuyuki Shiroguchi, Robotic data acquisition with deep learning enables cell image-based prediction of transcriptomic states. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 120 (1), e2210283120, 2023.
10. Guangwei Cui, Akihiro Shimba, Jianshi Jin, Nozomi Hojo, Takuma Asahi, Shinya Abe, Aki Ejima, Shinri Okada, Keizo Ohira, Ryoma Kato, Shizue Tani-ichi, Ryo Yamada, Takashi Ebihara, Katsuyuki Shiroguchi, Koichi Ikuta, CD45 alleviates airway inflammation and lung fibrosis by limiting expansion and activation of ILC2s. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 120 (36), e2215941120, 2023.
9. Sonoko Takahashi, Sotaro Ochiai, Jianshi Jin, Noriko Takahashi, Susumu Toshima, Harumichi Ishigame, Kenji Kabashima, Masato Kubo, Manabu Nakayama, Katsuyuki Shiroguchi, and Takaharu Okada, Sensory neuronal STAT3 is critical for IL-31 receptor expression and inflammatory itch. Cell Reports, 113433, 2023.
8. Jianshi Jin, Reiko Yamamoto, Tadashi Takeuchi, Guangwei Cui, Eiji Miyauchi, Nozomi Hojo, Koichi Ikuta, Hiroshi Ohno, Katsuyuki Shiroguchi, High-throughput identification and quantification of single bacterial cells in the microbiota. Nature communications, 13:863, 2022.
7. Guangwei Cui, Akihiro Shimba, Jianshi Jin, Taisaku Ogawa, Yukiko Muramoto, et al. A circulating subset of iNKT cells mediates antitumor and antiviral immunity. Science Immunology, 7, eabj8760, 2022.
6. Yanmeng Li, Jianshi Jin, Fan Bai, Cancer biology deciphered by single-cell transcriptomic sequencing, Protein Cell, 13(3):167–179, 2022.
5. Katsuyuki Shiroguchi *, Jianshi Jin*, and Reiko Yamamoto, Method for treating cell population and method for analyzing genes included in cell population. Application No.: PCT/JP2021/020338.
4. Jianli Tao*, Xiao-Wei Zhang*, Jianshi Jin*, Xiao-Xia Du, Tengfei Lian, Jing Yang, Xiang Zhou, Zhengfan Jiang and Xiao-Dong Su, Nonspecific DNA Binding of cGAS N Terminus Promotes cGAS Activation. The Journal of Immunology, 198(9):3627-3636, 2017.
3. Jianshi Jin*, Tengfei, Lian*, Chan Gu*, Kai Yu, Yi Qin Gao & Xiao-Dong Su, The effects of cytosine methylation on general transcriptional factors. Scientific Reports, 6:29119, 2016.
2. Jianshi Jin, Tengfei, Lian, X. Sunney Xie, Xiao-Dong Su, High-accuracy mapping protein binding stability on nucleosomal DNA using single-molecule method. Journal of Molecular Cell Biology, 6(5):438-40, 2014.
1. Sangjin Kim,* Erik Brostromer,* Dong Xing,* Jianshi Jin,* Shasha Chong, Hao Ge, Siyuan Wang, Chan Gu, Lijiang Yang, Yi Qin Gao, Xiao-dong Su, Yujie Sun, X. Sunney Xie, Probing Allostery Through DNA, Science, 339:816-819, 2013.
写给考生的话：
乐观面对挫折，坦然面对成绩！多坚持一下或许你就成功了！
